Прошло два года со времен военного противостояния между автоботами и десептиконами. За это время многое изменилось, что-то забылось, но общественность еще помнит что произошло, несмотря на гриф совершенной секретности под произошедшим в прошлом инцидентом. За это время автоботы успели вступить в союз с людьми, создав тайный боевой отряд отважных воинов. На плечах этого отряда, возглавляемого лидеров автоботов - Оптимусом Праймом, лежала обязанность охотиться и уничтожать оставшихся в живых их заклятых врагов десептиконов, остатки которых до сих пор разбросаны по всему миру. В этой нелегкой работе посильную роль оказывают люди, заинтересованные в скорейшем разрешении конфликта между двумя расами роботов. Тем временем юный Сэм Уитвикки, спасший в свое время Вселенную, живет обычной тихой жизнью обычного подростка. Единственным серьезным изменением, в жизни которого будет ближайший переезд, в связи с поступлением в колледж. Собирая вещи к предстоящему переезду, Сэм случайно обнаруживает в старой футболке осколок куба, от которого удалось избавиться несколько лет назад и в связи с намечающимся переездом решает отдать его своей девушке Микаэле. Согласившись взять осколок куба себе, Микаэла еще не знает, что этим самым она навлекает на себя смертельную опасность в лице оставшихся десептиконов, которые приложат максимум усилий, что бы завладеть им. Активизировавшись, в связи с найденным осколком куба десептиконы выясняют, что тот осколок не единственный и им даже удается украсть второй и с помощью него воскресить своего павшего лидера Мегатрона. Но на поиски осколка найденного Сэмом отправляют все оставшиеся силы, так как именно в нем содержатся потерянные знания, с помощью которых десептиконам удалось бы победить единственных защитников человеческой расы - автоботов.